卓尼縣森林分布廣,是甘肅省主要天然林區(qū)和黃河上游重要水源涵養(yǎng)區(qū),林地面積361.07萬畝,其中縣屬林95.77萬畝,省屬洮河林業(yè)局林地面積265.3萬畝,縣屬林森林覆蓋率15.80%,林區(qū)由波土落葉松、云杉、柏木、樺木等優(yōu)質(zhì)樹種,有鳥類153種、哺乳類動(dòng)物77種,有黑鸛、金錢豹、雪豹等8種國(guó)家一級(jí)保護(hù)動(dòng)物,金貓、猞猁等國(guó)家二級(jí)保護(hù)動(dòng)物,黑熊、黃羊等國(guó)家三級(jí)保護(hù)動(dòng)物。
卓尼縣境草場(chǎng)廣袤,總面積498萬畝,生長(zhǎng)著以禾本科和豆科為主的優(yōu)質(zhì)牧草408種,畜種主要有牦牛、犏牛、犏雌牛等優(yōu)良品種,發(fā)展畜牧業(yè)得天獨(dú)厚。2019年,各類牲畜存欄52.19萬頭(匹、只),總增率、出欄率、商品率分別達(dá)39.7%、45.2%、44.2%,肉產(chǎn)量1.21萬噸,奶產(chǎn)量0.75萬噸。